海外民族文獻(xiàn)研究所成立于2005年，主要職責(zé)是研究和整理出版流失海外的中國古代少數(shù)民族文獻(xiàn)和藝術(shù)品，為學(xué)校的學(xué)科建設(shè)服務(wù)。研究所的發(fā)展目標(biāo)是：努力建設(shè)成為我國有較高知名度的民族文獻(xiàn)研究中心，并為搜集保存我國流失海外敦煌西域民族古文獻(xiàn)學(xué)術(shù)資源最為完備的數(shù)字化資料和文獻(xiàn)中心；開展國際學(xué)術(shù)交流，建立高素質(zhì)的學(xué)術(shù)研究隊伍，完成一批有影響的學(xué)術(shù)科研成果。目前，研究所有才讓教授、嘎藏陀美教授、敖特根教授、扎西當(dāng)知教授、張秀清教授等專職研究人員6人。其中，博士生導(dǎo)師3人，碩士生導(dǎo)師4人。才讓教授被評為甘肅省高?？缡兰o(jì)學(xué)科帶頭人、甘肅省跨世紀(jì)學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人“333科技工程”第一、二層次人選、甘肅省領(lǐng)軍人才、國家民委領(lǐng)軍人才，嘎藏陀美教授被評為“國家民委突出貢獻(xiàn)專家”，扎西當(dāng)知教授入選“教育部新世紀(jì)優(yōu)秀人才計劃”。

2008年成立中國敦煌吐魯番學(xué)會少數(shù)民族文字專業(yè)委員會，秘書處設(shè)在本所。2011年獲批國家民委人文社科研究重點基地——西北民族文獻(xiàn)研究基地，2016年“敦煌少數(shù)民族文獻(xiàn)研究”入選國家民委創(chuàng)新團隊計劃等。

本所自2006年起，與上海古籍出版社、法國國家圖書館和英國國家圖書館合作，整理出版大型文獻(xiàn)集成《法藏敦煌藏文文獻(xiàn)》（1-22冊）《英藏敦煌藏文文獻(xiàn)》（1-9冊），并與俄國冬宮博物館合作出版了《俄藏黑水城藝術(shù)品》《俄藏希克沁藝術(shù)品》等重要研究資料。已完成國家社科基金項目7項，現(xiàn)主持國家社科重大招標(biāo)項目“藏傳佛教大辭典”、教育部哲學(xué)社會科學(xué)重大課題攻關(guān)項目“藏文歷史著作總目提要”、國家社科重點項目“敦煌藏文文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫”，及國家社科一般項目4項等。